בית המדרש בבינה (כולל הישיבה החילונית של בינה) הוא מקום ההוראה העיקרי של ארי אלון המלמד מדרש, תלמוד, אגדה וספרות. במקביל הוא מלמד גם במכון הרטמן בירושלים (שם הוא מכהן גם כעמית מחקר) ובמרכז ליאו בק בחיפה. בשנים שחלפו לימד, בין השאר, בסמינר "אורנים", סמינר הקיבוצים, גבעת חביבה, מכללת אילת, בית מורשה בירושלים, קולות, בית המדרש לרבנים בניו יורק ובית המדרש לרבנים בפילדלפיה. פרסם בין השאר את "בא אל הקודש – ל"ו אגדות נסתרות (הוצאת ידיעות אחרונות) ; "עלמא די" (הוצאת שדמות)  ; "יה בשבט" (הוצאת בינה) ו"דין רודף שלום – דרישות שלום לפרשות השבוע" (הוצאת בינה)